克孜勒陶镇地处东经75°20′ ～76°41′、北纬38°06′ ～38°56′，位于县城以南的昆仑山东坡，东与英吉沙县克孜勒镇相连，南与阿克塔拉、恰尔隆镇相邻，西与布伦口乡为邻，北与英吉沙县乌恰镇相连。镇政府驻地距县城直线距离为98千米。

克孜勒陶镇平均海拔2200米，西北部为高山寒冷气候，年降水量150～200毫米；东南部为浅山地带，属温带大陆性干旱气候，年均气温10.9℃，无霜期150天。经济以牧业为主，浅山坡地和河谷有较多的优质夏牧草。境内主要水系为依格孜牙河。有雪鸡、黄羊、盘羊等珍贵动物，有野生雪莲、当归、手掌参、锁阳、大芸、紫草、肉苁蓉等珍稀植物。矿产资源主要有铅、锌、铁、煤、大理石、水晶石等金属矿和非金属矿。